Реєстр визнає відмінності у статусі, владі, ролях і потребах чоловіків та жінок, а також вплив гендеру на можливості людей та взаємодію між ними. Реєстр визнає свої зобов'язання враховувати гендерний аспект у своїй роботі, та інформувати про це як в процесі впровадження, так і під час його роботи.

Хоча злочини можуть бути скоєні незалежно від статі, гендер часто має вплив на форму насильства. Сексуальне насильство може стосуватися людей будь-якої статі та сексуальної орієнтації. Реєстр прагне усунути гендерні бар'єри, що перешкоджають збору доказів сексуального насильства, та точно відобразити гендерні відмінності в залежності від того, яку шкоду, завданої постраждалим/ особам, хто пережив сексуальне насильство. 

Реєстр також повинен враховувати фактичні закономірності, пов'язані з різними категоріями заяв, коли йдеться про гендер. Наприклад, особи, які були змушені переселитися (були переміщені), особливо за межі України,  це переважно жінки та діти. З іншого боку, українські військовополонені - це переважно чоловіки. Реєстр прагне працювати з усіма категоріями з однаковою увагою та турботою, беручи до уваги особливі потреби та чутливі моменти, які можуть існувати при цьому.